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Marzo
- Alla ricerca di pianeti su cui avviare la terza fase del Progetto Genesis, la USS Reliant libera per errore Khan dal suo esilio su Ceti Alpha V.
- Khan si dirige al laboratorio del Progetto Genesis e uccide quasi tutti gli scienziati. L'Enterprise interrompe una crociera di addestramento cadetti per dargli la caccia.
- L'Enterprise e la Reliant si scontrano all'interno della Nebulosa Mutara. Khan viene ucciso, mentre il Capitano Spock si sacrifica per salvare la sua nave.
- Dopo il funerale di Spock, l'Enterprise recupera gli ufficiali della Reliant - abbandonati da Khan su Ceti Alpha V - e torna al Bacino Spaziale della Terra.
- La sera del rientro dell'Enterprise sulla Terra, Sarek - padre di Spock - apprende che il katra del figlio è sopravvissuto nella mente del dottor McCoy.
Aprile
- Kirk e alcuni dei suoi ufficiali rubano l'Enterprise, destinata alla demolizione, e la usano per raggiungere Genesis e recuperare il corpo di Spock, ricreatosi sul pianeta.
- Kruge, un comandante Klingon, ruba una parte dei piani di Genesis e ritenendo che si tratti di un'arma di sterminio di massa si reca su Genesis per appropriarsene.
- Dopo aver distrutto l'Enterprise per eliminare la minaccia klingon, Kirk e i suoi usano la nave di Kruge per recarsi su Vulcano dove corpo e katra di Spock vengono riuniti.
Giugno
- La Flotta Stellare cancella il Programma Transwarp.
Luglio
- Il Cercatore raggiunge la Terra e cerca di comunicare con le balene. Non ricevendo risposta, inizia a congelare il pianeta per sterilizzarlo prima di seminarvi nuovo DNA.
- Kirk e i suoi ufficiali, compreso un redivivo Spock, lasciano Vulcano per la Terra, dove li aspetta un processo con molti capi di imputazione.
- Kirk e i suoi ufficiali arrivano sulla Terra e scoprono la ragione dietro all'attacco del Cercatore. Per rimediare, effettuano un salto nel tempo al 1986, in cerca di due balene.
- La missione temporale ha successo: due balene del XX secolo parlano al Cercatore che interrompe l'attacco. Sulla Terra inizia la ricostruzione.
- Processo a Kirk e ai suoi ufficiali, che vengono giudicati "non colpevoli". Kirk viene giudicato colpevole di insubordinazione e retrocesso al grado di Capitano, mentre i suoi ufficiali sono dichiarati "non colpevoli".
- Al Capitano Kirk viene assegnato il comando di una nuova nave stellare: la NCC 1701-A USS Enterprise, gemella di quella distrutta su Genesis.
- Su Nimbus III un gruppo di abitanti del pianeta, guidati da un misterioso "profeta", rapisce gli ambasciatori federale, klingon e romulano.
- La Enterprise-A viene inviata su Nimbus III per risolvere la crisi degli ostaggi.
- La sonda terrestre Pioneer 10, lanciata nel marzo 1972, viene distrutta dalla IKS Okrona nello spazio klingon.
- Grazie alle facoltà telepatiche di cui è capace, Sybok di Vulcano - il misterioso profeta di Nimbus III - prende il controllo dell'Enteprise e si prepara a partire per Sha-ka-ree.
Agosto
- L'Enterprise parte per Sha-ka-ree, oltre la Grande Barriera al centro della Galassia. La IKS Okrona del Comandante Klaa la segue in segreto.